有關食品藥物管理署食用油中棉籽酚檢驗方法，係參考國際文獻資料並依照國際規範，方法通過確效試驗之評估後，才會據以進行檢體之分析。方法確效試驗則包括濃度與檢測值之線性關係、重複性、回收率等試驗。而檢驗結果除經多次檢驗確認，並有數據品質管制措施，確認無誤後，才會對外公開，並非一次檢驗之結果。本檢驗方法之定量極限為1 ppm，與國際方法一致。
關於民眾質疑為何日前公布之粗煉棉籽油檢驗結果並未檢出棉籽酚？係因粗煉棉籽油非粗榨產品，在廠商自國外進口時已於國外經過加熱、加鹼等半精煉處理，棉籽酚即已被去除。又，民眾質疑既然粗煉棉籽油已去除棉籽酚，為何廠商還需要再精煉？係因食用油精煉之主要目的是藉由脫膠、脫酸、脫色、脫臘及脫臭等過程，讓油品的外觀、品質及氣味等變得更好，利於油品之賣相及保存。
食品藥物管理署研擬之檢驗方法皆以嚴格之標準反覆確認，並與國際接軌。而檢驗技術及設備亦持續精進，在國際會議及論文發表場合上，展現我國優異之檢驗研究水準，與歐、美、日等國相較毫不遜色。