雲林縣衛生局於100年3月25日配合行政院消費者保護委員會，前往本縣斗六國小、鎮南國小、中山國小、立仁國小等4家學校，抽驗豬肉、雞肉、貢丸等產品共8件，送SGS檢驗動物用藥，結果斗六國小之「新竹貢丸」 1件檢出氯黴素2ppb（法規規定不得檢出），核與規定不符，案內產品來源係為本縣良冠企業社，另臺南市政府衛生局配合行政院消費者保護委員會於臺南市永康區三村國小抽驗冷凍原味貢丸，結果檢出氯黴素2.1ppb及恩氟沙星23ppb（法規規定不得檢出），核與規定不符，案內產品來源係為本縣嘉楠食品工業股份有限公司。
雲林縣衛生局於100年5月4日前往良冠企業社及嘉楠食品工業股份有限公司查察，該二廠之業者承認確為其製售，但原料肉來源係為明昌肉品行、台億食品公司，且均有屠宰合格證明，動物用藥並非他們自行添加，該批產品現場已無存貨，已請下游販賣業者回收未售完產品，另再前往明昌肉品行（為肉品分切場）查察，該行係向台糖公司標下畜牧場之豬隻，由畜牧場送至肉品市場宰殺後送回該行分切，另亦前往台億食品公司查察其豬隻來源為台糖公司、肉品市場及其契養之養殖場，豬隻於肉品市場及合法之屠宰場宰殺後分切再分部位合併冷凍販售。
本案檢出貢丸原料肉係來自不同屠體，因業者無法提供確切來源，雲林縣衛生局將依違反食品衛生管理法之規定裁處3-15萬元罰鍰，並責成業者落實加工製程品質管控，增加原料肉檢測動物用藥頻率，另也將對市售肉品及其加工製品加強抽驗，以維護大眾食的安全。